O Ministério da Defesa (MD) do Brasil foi criado por meio da Lei Complementar nº 97, durante o governo do presidente Fernando Henrique Cardoso. A sua fundação teve como objetivo central integrar e unificar o comando das três Forças Armadas brasileiras:
Marinha do Brasil, Exército Brasileiro e Força Aérea Brasileira (Aeronáutica). Antes da criação do ministério, cada uma dessas forças possuía o seu próprio ministério independente, submetido a um ministro militar. Com a nova estrutura, as antigas pastas transformaram-se em Comandos subordinados a um único Ministro de Estado da Defesa, cargo que historicamente passou a ser ocupado também por civis, fortalecendo a relação cívico-militar no país. O primeiro titular da pasta foi Élcio Álvares.